Étudier le déclin de la biodiversité pour mieux la conserver

Pourquoi le passé est-il si important pour le futur de la biodiversité ?

Nous savons aujourd’hui que le déclin massif de la biodiversité a débuté dans les années 1950, au moment de la modification significative des habitats naturels et de l’intensification de notre agriculture. À cette époque, l’écologie était une discipline minoritaire et les outils manquaient pour étudier les phénomènes complexes liés aux écosystèmes et pour dénombrer les individus. Ce n’est qu’une vingtaine d’années plus tard que l’on s’est véritablement aperçu que certains groupes taxonomiques* tels que les chauves-souris s’étaient effondrés. Est alors apparue la nécessité de remonter le temps pour en trouver les causes.En identifiant précisément ce qui a fragilisé certaines espèces, nous serons mieux à même d’agir pour les protéger. Il sera aussi possible de prédire les risques de déclin à venir.

Comment les archives des muséums permettent-elles de retracer le passé ?

Les spécimens qui y sont conservés depuis le 19e siècle sont de plus en plus utilisés par les chercheurs pour étudier la diversité spécifique et génétique. Grâce aux méthodes moléculaires, à partir de leur ADN, il est possible de retrouver des caractères génétiques qui n’existent plus et de tracer ainsi la diminution de la diversité génétique. Cela a bien été mis en évidence pour de nombreuses espèces animales, comme le loup gris, l’ours brun d’Europe, le hamster d’Europe, ou le guépard. Leur raréfaction soudaine a créé un « goulot d’étranglement génétique », les animaux survivants représentant une part amoindrie de la diversité originelle. Or l’appauvrissement génétique est souvent le premier marqueur du déclin d’une espèce. Il mène à ce que l’on nomme un « vortex d’extinction » : la consanguinité peut générer plus de mortalité et moins de fécondité.

Pourquoi le guano de chauve-souris représente-t-il une autre archive de choix ?

L’accumulation chronologique des déjections dans le gîte des chauves-souris forme une sorte d’archives sédimentaires renfermant quantité d’informations : polluants auxquels les animaux ont été exposés, ADN, ADN des proies et parasites, pollens… Il est ainsi possible de connaître leur régime alimentaire, quel était le paysage dans lequel des individus chassaient, et d’identifier des marqueurs de pression environnementaux. À travers le projet Repast, financé par l’Agence nationale de la recherche, le laboratoire Chrono-Environnement mène des travaux novateurs à partir de prélèvements effectués sur une dizaine de sites en Bourgogne-Franche-Comté. Nous avons réussi à établir des protocoles pour amplifier l’ADN, autrement dit pour le multiplier en vue de l’étudier, ce qui représentait un véritable challenge technique. Nous entamons maintenant la phase d’étude des échantillons.